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我国构建首个斑马鱼定向突变体库1/4与人疾病相关

放大字体  缩小字体 时间:2019-12-21 17:45:20 来源:澎湃新闻 作者:责任编辑。陈微竹0371

(原标题:我国构建首个大规划斑马鱼定向骤变体库,1/4与人疾病相关)

汹涌新闻记者 贺梨萍

近20年之前,科学家们开端对斑马鱼基因组打开测序,这是一种从事脑和其他器官前期发育研讨的生物学家们最喜欢的形式生物。跟着其基因组被连续解密,斑马鱼变成研讨人类疾病、讨论疾病医治的首选动物。

近来,来自我国科学家的“斑马鱼1号染色体全基因敲除方案”的研讨成果在线发表于世界期刊Genome Research。这是世界上初次大规划的斑马鱼反向遗传学骤变体库构建和遗传挑选方案。

该论文的作者均来自于由我国科学院水生生物研讨所、清华大学、我国科学院动物研讨所、北京大学等24家组织的学者组成“斑马鱼1号染色体全基因敲除联盟(ZAKOC)”。论文榜首作者单位为中科院水生所,榜首作者为中科院水生所研讨员孙永华,通讯作者为动物所研讨员刘峰,中科院院士、清华大学教授孟安明和中科院院士、水生所研讨员朱作言。

斑马鱼是展开生命科学、健康科学、环境科学等研讨的重要形式动物。斑马鱼基因组巨细约1.5Gb,共含有25条染色体,约32000个基因。其间,1号染色体巨细约60Mb,占斑马鱼悉数基因组的4%。

在斑马鱼研讨历史上,欧美学者建议过几回大规划的随机诱变骤变体库。2013年2月,新一代基因修改技能CRISPR/Cas9体系面世,我国斑马鱼学界即自发组织了“斑马鱼1号染色体全基因敲除方案联盟(ZAKOC)”,运用该技能对斑马鱼基因组进行大规划、全染色体水平的体系性基因敲除作业,成为全球最早发动的运用该技能施行形式动物全基因组水平敲除的研讨方案。

ZAKOC联盟使用CIRISR/Cas9技能,针对斑马鱼1号染色体上的1333个基因进行体系性基因敲除,成功敲除了其间1029个基因,取得针对636个基因的1039个可传代的骤变型。

这一继续6年多的研讨,初次完成了脊椎动物整条染色体的体系性基因敲除,不只引领了世界斑马鱼表型组研讨,并且诞生了我国首个大规划斑马鱼定向骤变体库。

现在,一切骤变品系和遗传信息悉数经过国家水生生物种质资源库——国家斑马鱼资源中心对学术界揭露(http:///TargetList.aspx)。

该方案产生了现在学术界规划最大的经试验验证的有用和无效gRNA序列库,经过大数据分析,提醒了gRNA的敲除功率与其靶位GC含量出现亲近的正相关性。在一切的骤变体中,约1/4与人类疾病相关。

该论文还一起展现了若干代表性的骤变体及其表型,发现了纯合骤变体与基因敲降的表型不一致,进一步丰厚了最近发现的“遗传补偿效应”理论。

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